サハラ砂漠以南のいわゆるブラックアフリカに住む黒人は古くからアラブ人やペルシア人の奴隷として扱われており、人種差別の対象であった。イスラム圏の偉大な哲学者であるイブン・ハルドゥーンでさえも黒人を差別の対象としている。アッバース朝時代には南イラクの大規模農業で使役していた黒人奴隷が過酷な労働環境に不満を抱き反乱を起こしている（ザンジュの乱）。
大航海時代以降はヨーロッパ人が黒人を奴隷として使役した。ヨーロッパ人はブラックアフリカに住む黒人を主に奴隷として使役してきた。ヨーロッパ人に購入された黒人は奴隷船の船倉に積み込まれ、新大陸等の市場へ輸送された。奴隷市では商品として台の上に陳列され、売買された。彼ら黒人奴隷は人格を否定され、家畜と同様の扱いであった。軽い家内労働に従事できる者や奴隷身分から解放される者はごく少数だった。こうしたヨーロッパ人による奴隷制度は、1888年にブラジルが奴隷制度を廃止するまで続いた。
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ヨーロッパ人は、アメリカ・インディアンやマヤ、アステカなどの征服地、植民地支配における先住民を差別し、虐待・大量虐殺などを行い、伝染病の影響もあり先住民は激減した。（フィリップ・シェリダンの「よいインディアンとは死んだインディアンの事」発言）。スペイン領では、ラス・カサスらキリスト教伝道師が先住民保護に奔走するが、これは、結果的に労働力の代替としての黒人奴隷導入につながる。近代以降も白人、混血、先住民で社会階層が分かれている国家が少なくない。